- Las hermanas Wachowski se interesaron en Hideo Kojima para crear un videojuego de The Matrix.
 - Un ejecutivo de Konami rechazó la propuesta para mantener a Kojima centrado en la saga Metal Gear Solid.
 - Shiny Entertainment acabó desarrollando los juegos Enter the Matrix y The Path of Neo.
 
Tras el éxito de The Matrix en 1999, surgieron rumores sobre un posible videojuego. Se especuló que Konami, y en concreto el equipo de Hideo Kojima, podría estar involucrado en el proyecto. Las propias Wachowski contactaron directamente con Kojima para proponerle la idea.
Sin embargo, según un antiguo vicepresidente de licencias de Konami, Kazumi Kitaue, uno de los altos cargos de la compañía, rechazó la oferta. La razón principal era mantener a Kojima enfocado en el desarrollo de Metal Gear Solid 2: Sons of Liberty, que estaba en una fase crucial. A pesar del rechazo, las Wachowski y Kojima pudieron asistir juntos al estreno de The Matrix en Japón.
Finalmente, la licencia de The Matrix fue otorgada a Shiny Entertainment, quienes lanzaron Enter the Matrix en 2003 y The Path of Neo en 2005. Existe fascinación entre los fans sobre cómo habría sido un juego de Matrix desarrollado por Kojima, dado su interés y las similitudes que algunos elementos del juego compartían con la película.